Záleží na pojetí životnosti. Pokud vnímáme bacily jako neživé věci (vzor hrad), píšeme bacily (např. ničit bacily). Pokud je vnímáme jako živé organismy (vzor pán), píšeme bacili (např. bacili se množí). V češtině převažuje neživotné skloňování s tvrdým „y“.
